Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ssxb3Q6XAS4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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