Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms