Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms