Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms