Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GcsamQ6RFH4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GcsamQ6RFH4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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