Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms