Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn2Q6PHP6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms