Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasa4Q6PFQ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rasa4Q6PFQ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms