Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmeff1Q6PFE7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms