Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms