Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtifQ6PEE2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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