Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms