Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms