Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms