Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc4Q6P2L7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms