Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnpo3Q6P2B1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms