Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSV7

Fam149b1, Protein FAM149B1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam149b1Q6NSV7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam149b1Q6NSV7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam149b1Q6NSV7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms