Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ltv1Q6NSQ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ltv1Q6NSQ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms