Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms