Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms