Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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