Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms