Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Krt40Q6IFX3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Krt40Q6IFX3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Krt40Q6IFX3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Krt40Q6IFX3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Krt40Q6IFX3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Krt40Q6IFX3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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