Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6GQU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6GQU0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6GQU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6GQU0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms