Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms