Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg9bQ6EBV9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms