Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms