Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q6DFW0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6DFW0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms