Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170Q6A065 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170Q6A065 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170Q6A065 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms