Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ablim3Q69ZX8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ablim3Q69ZX8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms