Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp4Q68FH0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms