Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms