Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms