Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms