Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC080695Q66JY9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms