Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms