Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms