Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Sp9Q64HY3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms