Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf4Q64310 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Surf4Q64310 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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