Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit1Q64282 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms