Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
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Ccdc18Q640L5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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Ccdc18Q640L5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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