Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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AtmQ62388 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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AtmQ62388 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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AtmQ62388 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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AtmQ62388 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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AtmQ62388 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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AtmQ62388 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtmQ62388 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms