Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt6hQ62383 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms