Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsnQ62348 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsnQ62348 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsnQ62348 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TsnQ62348 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms