Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms