Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms