Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms