Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms