Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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