Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhocQ62159 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhocQ62159 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms